Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Crnkl1P63154 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms