Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn18P56857 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms