Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa8P50706 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms