Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Tmod1P49813 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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