Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Epb41P48193 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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