Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rab11bP46638 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms