Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Tnfsf9P41274 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf9P41274 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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