Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Usp4P35123 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Usp4P35123 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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