Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Cd28P31041 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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