Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
VtnP29788 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
VtnP29788 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
VtnP29788 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms