Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Atxn10P28658 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Atxn10P28658 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Atxn10P28658 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Atxn10P28658 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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