Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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Hoxd10P28359 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hoxd10P28359 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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