Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18530 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18530 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18530 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18530 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms