Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb1P17919 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms