Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Defa-rs1P17533 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms