Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb2P13373 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms