Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
DmdP11531 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DmdP11531 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
DmdP11531 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
DmdP11531 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nkd1-202ENSMUST00000169179 4081 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
DmdP11531 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DmdP11531 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms