Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxd4P10628 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms