Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P10404 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P10404 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
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