Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ccl20O89093 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl20O89093 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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