Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CopeO89079 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CopeO89079 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CopeO89079 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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CopeO89079 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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CopeO89079 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CopeO89079 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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