Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21866J3QMH4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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