Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tmem200cJ3QK46 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tmem200cJ3QK46 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tmem200cJ3QK46 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tmem200cJ3QK46 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Tmem200cJ3QK46 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmem200cJ3QK46 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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