Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Srp72F8VQC1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms