Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm28048F7BCN0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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