Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms