Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Phf11cB4XVP9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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