Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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