Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rabgef1Q9JM13 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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