Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms