Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Med27Q9DB40 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms