Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Nop56Q9D6Z1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nop56Q9D6Z1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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