Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Nicn1Q9CQM0 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms