Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ciao1Q99KN2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ciao1Q99KN2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Ciao1Q99KN2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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