Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms