Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Srsf4Q8VE97 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms