Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubxn4Q8VCH8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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