Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Abcf3Q8K268 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.9 ms