Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab11fip3Q8CHD8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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