Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Amigo3Q8C2S7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Amigo3Q8C2S7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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