Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Atg16l1Q8C0J2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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