Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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