Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TtpaQ8BWP5 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TtpaQ8BWP5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms