Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fbxo38Q8BMI0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms