Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnrc6bQ8BKI2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tnrc6bQ8BKI2 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms