Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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ChfrQ810L3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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ChfrQ810L3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ChfrQ810L3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms