Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NischQ80TM9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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