Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ube2q1Q7TSS2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms