Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mrps31-201ENSMUST00000033934 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm42731-201ENSMUST00000201839 1641 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClmQ7TSN2 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms