Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1cQ7TSF0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms